O Laboratório Morfofuncional da EMCM consiste no local onde conteúdos de Anatomia Humana, Histologia, Fisiologia e Embriologia são ministrados por meio de uma dinâmica integrada de atividades teórico-práticas. Este espaço é utilizado pelo curso de Medicina e programas de pós-graduação desenvolvidos na instituição, cujo obejtivo principal é proporcionar aos estudantes uma dinâmica integrada de atividades teórico-práticas de ciências moforfuncionias com os conteúdos das ciências clínicas em diferentes módulos e disciplinas ao longo do curso.